Разбор по составу:
пилотировать
Части слова (морфемы):
- пилот — корень
- ир, ова, ть — суффиксы
- окончание отсутствует
Основа слова: пилотирова
ТЬ — это формообразующий суффикс. Он не входит в основу слова, но его можно выделить как окончание (обозначение зависит от программы обучения).