Разбор по составу:
наводнить
Части слова (морфемы):
- на — префикс (приставка)
- вод — корень
- н, и, ть — суффиксы
- окончание отсутствует
Основа слова: наводни
ТЬ — это формообразующий суффикс. Он не входит в основу слова, но его можно выделить как окончание (обозначение зависит от программы обучения).